Program studi Agroteknologi Fakultas Pertanian Universitas Madako Tolitoli memiliki kurikulum berbasis kompetensi di bidang Agroteknologi yang menghasilkan siap pakai di masyarakat. Program studi Agroteknologi merupakan gabungan bidang ilmu pembelajaran yaitu agronomi, hortikultura, proteksi tanaman, ilmu tanah dan teknologi pertanian. Prodi Agroteknologi selalu siap memberikan ilmu dasar yang kuat, interdisipliner, keterampilan yang memadai dan juga kemampuan penalaran yang kuat dalam menghadapi permasalahan-permasalahan sektor pertanian kini dan yang akan datang